La Maestría en Ingeniería Industrial, enmarcada en su objetivo misional de formar Profesionales con alto nivel de Investigación, bajo tres énfasis que pueden ser elegidos por los estudiantes: Énfasis en Sistemas Productivos y Logísticos, Énfasis en Inteligencia Computacional para los Negocios y Énfasis en Gestión de Organizaciones y Proyectos